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蛋白質體學(proteomics)的概念自從 1995 年被提出後(3),蛋白質體(proteome)的分析便成為後基因時代生命科學領域最重要的課題之一;簡單地說,蛋白質體學是針對整體蛋白質作定性、定量及功能的分析;以質譜為主的技術平台已成為研究蛋白質體學的主力工具之一。
蛋白質體學(proteomics)中蛋白質的身份鑑定(protein ID)使用LC-MS/MS來進行,這種技術在同一個樣品一次分析中盡可能的分析出存在樣品中全部的蛋白質與胜肽(peptide),其原理首先是將純化後的蛋白質用水解酵素(例如:trypsin)將蛋白質隨機切割為胜肽(peptide)片段,去除鹽類後首先先打入 liquid chromatography進行初步的分離降低樣品的複雜程度,接著將分離後的混合物注入質譜儀進行分析,最後質譜儀就可以藉著這些胜肽片段的質荷比(M/Z)與數據庫進行分析比對而大規模的得到樣品中幾乎所有蛋白質的身份
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