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代謝體學（英語：metabolomics）是涉及代謝物、小分子底物、中間體和細胞代謝產物的化學過程的科學研究。具體而言，代謝物組學是「對特定的細胞過程遺留下的特殊化學指紋的系統研究」，即對其它們的小分代謝產物的整體研究。代謝物體學研究：從組織，血漿，尿液，唾液，細胞等中收集樣品，再添加內標和衍生化方法萃取代謝產物，再對代謝產物進行定性、定量（氣相層析、液相層析以及和質譜或NMR光譜）。最後對輸出數據進行處理與統計分析（例如PCA）。 許多生物信息學工具和軟體可用於識別與疾病狀態和結果的關聯，確定顯著的相關性並利用現有的生物學知識表徵代謝特徵。